IOTA était initialement connu sous le nom de Jinn et a été présenté au public lors d'une vente collective en septembre 2014. Le réseau a officiellement été lancé en 2016. Le projet a été cofondé par Sergey Ivancheglo, Serguei Popov, David Sønstebø et Dominik Schiener. Avec le temps, la Fondation IOTA s'est développée, avec des membres de l'équipe désormais basés dans plus de 25 pays. La Fondation IOTA, une organisation à but non lucratif, a été lancée en octobre 2017. Elle vise à développer le réseau et a établi des partenariats avec diverses entités, dont le constructeur automobile Volkswagen et la ville de Taipei pour des projets intelligents.